入关后的顺治，在母亲的教导下，随着年龄的增长、做君王的才华也逐渐显露出来。顺治继承皇位之初，全国的形势并不十分有利于清王朝的统治。
以李自成为首的农民军仍在陕西、山西、云南、四川等地抗击清军；江南又不断地涌现出一些明王朝的宗室子弟各自为政，举起反清复明的大旗；而北方又因清军入关后的圈地，使大批农民失去土地，不断爆发小股的农民起义。
一些正统思想浓厚的文人不肯出任清朝官职，隐居山村讲学立说，宣传民族意识，唤起汉人的反清情绪，威胁着清朝的统治。
对于这些问题，顺治帝及时地做出相应的决断。首先集中优势兵力围剿农民起义军。农民军由于连续作战，军队得不到休息与补充，人员伤亡很大，无论是人力、物力还是战斗力上都远远不再能与清军抗衡，杀到最后李自成只剩下28骑，被围在湖北九宫山，全部壮烈牺牲。
顺治消灭农民起义军后，经10余年的围剿，先后灭掉弘光、隆武、绍武、永历等南明小王朝，逼迫抗清力量较强的郑成功退守台湾。
顺治帝遵照太后的意见，加强了思想文化阵地的占领和统治。1652年8月27日孔子诞辰那天，秋高气爽，阳光灿烂，祭孔大典在北京国子监隆重举行。祭前派人将孔子第六十五世孙孔允植，接到北京参加祭典仪式，清军入关后封孔允植为衍圣公。
祭祀仪式完全按明制进行。顺治帝首先用香汤淋浴，换上祭孔衣服，然后带领文武大臣毕恭毕敬驾临国子监，走在最前面的16名太监抬着精制的祭品。
顺治帝在中午时分，到达国子监。祭祀大典在悠扬的乐曲声中开始。顺治帝面向国子监广场，躬迎孔夫子圣灵前来享受祭品，然后转过身来，恭恭敬敬地向孔夫子的神位献上一幅杏黄色的绢，披盖在神位上，再恭恭敬敬向孔夫子神位敬酒三次，行礼三次，祭酒高喊“礼成”，祭孔大典就圆满结束了。
典礼结束后，顺治帝接见了衍圣公孔允植及孔、孟、颜、曾四姓子孙及五经博士，勉励并赏赐一番，同时诏告天下：“圣人之道，如日中天，上之赖以政治，下之资以事君，学官诸生共勉之。”
顺治帝祭孔的消息不胫而走，众多儒生对此佩服得五体投地，盛赞顺治帝是真龙天子。一些有识之才也不再隐居，出来展示才华了。
祭孔后，顺治帝又开始认真学习汉族文化，从历史文献、著名经典，到稗官小说传奇、野史无所不读，从中吸取不少治国安邦的道理。正当顺治帝为创造一个太平盛世大展宏图时，却不幸身染重病，不治而亡，年仅23岁。
顺治帝：即爱新觉罗·福临。是清太宗爱新觉罗·皇太极的第九子。其母为永福宫庄妃，即孝庄文皇后。
祭孔：是民间的一种对“先贤”的尊敬仰慕和追思的纪念活动，公元前195年，汉高祖经过鲁国，祭祀孔子，这是帝王祭孔的开始。
